La gestión del departamento de Contabilidad está incluida en el proceso de Finanzas del IAC. Este departamento se encarga de la contabilización de todos los gastos e ingresos gestionados por este centro, elaboración de las Cuentas Anuales presentada a la IGAE, de la custodia de las facturas, de la elaboración y presentación de todos los modelos de impuestos, la actualización y mantenimiento de los datos maestros (financieros) en SAP, elaboración de informes de control financiero y presupuestario para su presentación a las distintas unidades internas del IAC y respuesta a los distintos requerimientos del exterior.